L'Article 10 ( Arrêté du 09/02/2009 ) interdit effectivement de modifier sa plaque d'immatriculation. Par là même, il faut comprendre qu'elle doit rester lisible pour qu'elle puisse permettre votre identification. Rajouter un logo, quel qu'il soit; n'empêche en aucune façon, l'identification du propriétaire du véhicule.
L'identifiant territorial est optionnel et non obligatoire. De ce fait, il me semble logique, que relever une infraction pour ce simple motif, est inapproprié.(annexes 2 à 5 du dit Arrêté ).
Contester le relevé d'une infraction pour le motif du logo, est donc, à mon humble avis, parfaitement recevable auprès des juridictions.
Je reconnais cependant que les lois Françaises sont souvent complexes et méritent une "lecture plus approfondie" pour comprendre le sens de celles ci.